İlk savaş ve Evangelion’un tanıtımı.

Shinji’nin yeni hayatına alışması.

Yalnızlık ve iletişim sorunları.

Shinji’nin kaçışı ve geri dönüşü.

Rei Ayanami ile tanışma.

Rei’nin fedakarlığı.

Deneysel Evangelion birimi.

Asuka Langley Sohryu sahneye çıkar.

Shinji ve Asuka’nın uyumlu savaşı.

Asuka’nın cesur görevi.

Elektrik kesintisi sırasında mücadele.

Tokyo-3’ün savunması.

Bilgisayar sistemine saldırı.

Psikolojik değerlendirme.

Karakterlerin kişisel hayatları.

Shinji’nin zihinsel mücadelesi.

Yeni pilotun seçimi.

Shinji’nin trajik savaşı.

Shinji’nin Evangelion’a dönüşü.

Shinji’nin içsel yolculuğu.

Geçmişin ortaya çıkışı.

Asuka’nın psikolojik çöküşü.

Rei’nin sırrı ortaya çıkar.

Kaworu Nagisa ile karşılaşma.

Karakterlerin içsel sorgulamaları.

Serinin felsefi finali.